下面就來介紹一下simplifyEnrichment包是如何展示GO富集結果的。這里用該包中數(shù)據(jù)做一個演示。
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默認展示circ 數(shù)據(jù)前10個GO Term,通過參數(shù) nsub 調(diào)整需要展示的GO Term chord_dat ()將作圖數(shù)據(jù)構建成GOChord() 要求的輸入格式;一個二進制的關系矩陣, 1 表示基因?qū)儆谠揋O Term, 0 與之相反。
set,可以是差異表達基因,也可是正選擇基因或者加速進化基因。通常,只要具有這些基因的gene symbol或者是geneid,都可以利用該軟件進行分析。
clusterProfiler是一個功能強大的R包,同時支持GO和KEGG的富集分析,而且可視化功能非常的優(yōu)秀,本章主要介紹利用這個R包來進行Gene Ontology的富集分析。
首先,打開 TBtools GO 富集分析界面 整體如上,一共三個文件:具體示例如下 點擊 Start ,隨后等待即可。完成時會有彈窗提示。
topGO是一個半自動的GO富集包,該包的主要優(yōu)勢是集中了好幾種統(tǒng)計檢驗的方法,目前支持的統(tǒng)計方法如下:BiocManager:install(topGO)需要R的版本為=10,但biocmanager安裝需要的R版本更高,現(xiàn)在應該是6。
1、golang 中 map的實現(xiàn)結構為: 哈希表 + 鏈表。 其中鏈表,作用是當發(fā)生hash沖突時,拉鏈法生成的結點。可以看到, []bmap 是一個hash table, 每一個 bmap是我們常說的“桶”。
2、創(chuàng)建需要使用的embed.FS對象 靜態(tài)資源目錄如下:這里注意,//go:embed static注釋會引導Static embed.FS尋找到我們的靜態(tài)資源目錄,因此務必不要遺漏設置。
3、前面,我們講了map的用法以及原理 Golang中map的實現(xiàn)原理 ,但我們知道,map在并發(fā)讀寫的情況下是不安全。
1、百度,臉書等產(chǎn)品,用的就是PHP,不過,近些年,PHP在編程語言的排行榜上的排名有所下降。再來說說Python,最開始的話作為膠水語言存在。可是隨著人工智能的興起,Python一躍成為最火的編程語言。
2、1)各種編程語言涌現(xiàn)。如:Go、Swift、Rust、Dart、Kotlin等等,雖然有些并不直接和PHP有競爭關系;這些現(xiàn)代的編程語言,吸引了不少人學習;2)移動互聯(lián)網(wǎng)的興起。
3、PHP主要用來做網(wǎng)站開發(fā),許多小型網(wǎng)站都用PHP開發(fā),PHP是開源的,這是使得PHP經(jīng)久不衰的原因。在電商、社區(qū)等方面,PHP具備非常成熟的開源代碼和模板,因此使得PHP應用極為廣泛。劣勢是受眾較小,有可替代性。
4、這背后的一個重要原因就是Java非常,因為我把它列為2021年要注意的編程語言的前10名。它的Write-Once-Run-Anywhere功能允許在一臺機器上初始設置代碼并在另一臺機器上運行。
5、PHP的優(yōu)劣勢 PHP主要用于網(wǎng)站的開發(fā),很多小網(wǎng)站都是用PHP開發(fā)的。PHP是開源的,這是PHP得以長久的原因。在電子商務,社區(qū)等領域,PHP應用程序非常廣泛,因為PHP提供了非常成熟的開放源代碼和模板。
文章題目:go語言數(shù)據(jù)可視化 go語言繪圖
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