上調基因的過度表達GO術語是什么?

基因本體論Gene Ontology (GO)，提供了生物功能(“術語”)及其相互關系的邏輯結構，表現為有向無環圖。

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過表達，即表達過度，當基因表達（轉錄）的嚴格控制被打亂時，基因可能不恰當被“關閉”，或以高速度進行轉錄。高速轉錄導致大量mRNA產生，大量蛋白質（protein）產物出現。

“基因過表達”：基因表達本來是受到各種內外信號的精確調控的，一旦這種調控機制的任何一個環節出現問題就會失控。

上調就是基因轉錄成mRNA時受到正向調控，促進表達。下調是受到抑制，表達量減少。在RNA聚合酶的催化下，以DNA為模板合成mRNA的過程稱為轉錄（transcription）。

詳解GO的層級關系在富集分析中的應用

1、根據所有富集到的GO terms， 從整個GO Graph中取出一個子圖subgraph， 圖中有顏色的節點為富集到的GO， 顏色的深淺有P值決定， 節點的大小由degree決定。

2、GO富集的根本問題在于一個基因對應的GO term有多個，一個term對應多個gene，同時還有層級關系。這樣導致如果一個term顯著富集，那和它共享很多基因的term也會顯著富集。

3、GO富集分析原理簡介和DAVID的GO富集分析方法操作演示 尋找差異表達的基因并挖掘它們可能的功能，是我們進行RNA測序的最主要目的。

4、3 GO富集分析 加載了注釋庫之后，讀取基因列表文件，并使用clusterProfiler的內部函數enrichGO()即可完成GO富集分析。讀取基因列表文件，并使用clusterProfiler的內部函數enrichKEGG()即可完成KEGG富集分析。

5、功能富集分析：功能富集需要有一個參考 數據集 ，通過該項分析可以找出在統計上顯著富集的GO Term。該功能或者定位有可能與研究的目前有關。

GO數據庫介紹(轉載)

1、GO是用一套統一的詞匯表來描述生物學中的分子功能、生物過程和細胞成分。

2、官方：基因本體（GO）知識庫是有關基因功能的全球最大信息來源。 這些知識既是人類可讀的，也是機器可讀的，并且是生物醫學研究中大規模分子生物學和遺傳學實驗的計算分析的基礎。

3、性質不同 go是計算機編程語言。KEGG基因組破譯方面的數據庫。

4、對于未知基因名的序列，可以用序列直接檢索GO數據庫。點擊AmiGO首頁上方的“BLAST”，進入檢索界面。在檢索框輸入氨基酸或核酸序列或上傳序列文件，檢索工具能自動識別并相應地選擇BLASTP或BLASTX來與數據庫中的序列進行比對。

網頁標題：有向無環圖go語言 有向無環圖適用于什么計算
轉載來于：http://vcdvsql.cn/article14/dcsgsge.html

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