Linux文本操作常用命令

在Linux系統里常用于文本查看、操作、統計的命令：

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通過多敲鍵盤，形成手感 肌肉記憶 ，熟練掌握這些命令，在以后生信分析中游刃有余。以下是每個命令的詳細的介紹（主要是跟著 生信技能樹小郭老師 學習做的筆記）

接下來通過示例把10個命令的常用參數和用法展示出來：

參數的用法介紹：

注意事項：

用 cat 命令可以 查看文本 ，也可以 編輯文本 ，編輯文本要加 符號，退出時，另起一行，按 control C 退出

zcat可以查看壓縮的文本文件，tac逆向查看

結合 管道符| 使用

head / tail -n :查看文件的前 / 后 n 行，默認 10 行 （在R語言里head和tail默認是前6行）。

less命令用得最多 ，more命令用得比較少

3.1 less命令

less [參數] 文件名

less命令重要的補充用法1 ：

需要注意 退出 ：只要使用less命令， 按q鍵

less命令重要的補充用法2 ：

參數用法：

less命令 不加參數 查看文件：

less命令加 -N參數 查看文件：顯示行號

less命令加 -S參數 查看文件：單行顯示，非常規整

對比：less和cat命令顯示文本行號的用法：less -N，cat -n

3.2 more命令

**more ** 逐頁查看，按空格翻頁，按回車換行 ，more命令一般很少用，熟練掌握less命令就好

查看壓縮文件

wc 統計字符是也把換行符統計進去，但是別的命令不一定會把換行符算進去，。

常見參數:

切記：用less命令，按q退出

cut命令是按關鍵詞來切的

常見參數:

排列前：

排列后：

解釋：1和0比，1大；7和0比，7大…在sort字典排序里，100816比1737小，所以100816排在前面。

命令行查看一個表格結構時，因為制表符對齊的原因，出現一個錯位的現象。還有 字典排序 可能和我們平時的認知不一樣，所以 加上-n參數 ， 讓數值有數學意義上的大小來排序 。

uniq命令去重，只有兩行出現重復，而且是相鄰的兩行，如果不相鄰，即使出現兩行一模一樣，不會去重。

uniq命令通常和sort命令搭配使用

換其它文件試試

總之，uniq命令使用時經常和sort一起

常見參數:

常見用法1：

paste file1 file2

-s :按行合并 演示

常見用法2 : paste - -

常見參數:

要養成一個好習慣，原始數據不要輕易修改，修改的東西另外保存，文本保存用 (重定向)或是 (追加)

1. 用 less 查看 example.gtf ，然后管道符傳遞給 wc

2. 截取 example.gtf 第 9 列的內容

3. 在第2步的基礎上截取分號分割的第1列

4. 在第3步的基礎上排序、去重復并統計

5. 在第4步的基礎上，將空格替換成制表符

補充小知識 ：

清屏 ：control L

查看歷史（輸入過的）命令 ：history

linux常用的命令有哪些

Linux運維人員必會的120個命令

來自《跟老男孩學Linux運維：核心系統命令實戰》一書

前言

第1章 Linux命令行簡介 / 1

1.1Linux命令行概述 / 1

1.2在Linux命令行下查看命令幫助 / 4

1.3Linux shutdown reboot halt / 9

關機：

shutdown -h now

halt

init 0

第2章 文件和目錄操作命令 / 13

2.1pwd：顯示當前所在的位置 / 13

2.2cd：切換目錄 / 16

2.3tree：以樹形結構顯示目錄下的內容 / 18

2.4mkdir：創建目錄 / 22

2.5touch：創建空文件或改變文件的時間戳屬性 / 27

2.6ls：顯示目錄下的內容及相關屬性信息 / 30

2.7cp：復制文件或目錄 / 39

2.8mv：移動或重命名文件 / 42

2.9rm：刪除文件或目錄 / 45

2.10rmdir：刪除空目錄 / 48

2.11ln：硬鏈接與軟鏈接 / 49

2.12readlink：查看符號鏈接文件的內容 / 54

2.13find：查找目錄下的文件 / 55

2.14xargs：將標準輸入轉換成命令行參數 / 68

2.15rename：重命名文件 / 71

2.16basename：顯示文件名或目錄名 / 72

2.17dirname：顯示文件或目錄路徑 / 72

2.18chattr：改變文件的擴展屬性 / 73

2.19lsattr：查看文件擴展屬性 / 75

2.20file：顯示文件的類型 / 76

2.21md5sum：計算和校驗文件的MD5值 / 77

2.22chown：改變文件或目錄的用戶和用戶組 / 80

2.23chmod：改變文件或目錄權限 / 81

2.24chgrp：更改文件用戶組 / 85

2.25umask：顯示或設置權限掩碼 / 86

2.26老男孩從新手成為技術大牛的心法 / 90

第3章 文件過濾及內容編輯處理命令 / 91

3.1cat：合并文件或查看文件內容 / 91

3.2tac：反向顯示文件內容 / 103

3.3more：分頁顯示文件內容 / 104

3.4less：分頁顯示文件內容 / 107

3.5head：顯示文件內容頭部 / 109

3.6tail：顯示文件內容尾部 / 111

3.7tailf：跟蹤日志文件 / 114

3.8cut：從文本中提取一段文字并輸出 / 115

3.9split：分割文件 / 117

3.10paste：合并文件 / 118

3.11sort：文本排序 / 123

3.12join：按兩個文件的相同字段合并 / 127

3.13uniq：去除重復行 / 129

3.14wc：統計文件的行數、單詞數或字節數 / 131

3.15iconv：轉換文件的編碼格式 / 133

3.16dos2unix：將DOS格式文件轉換成UNIX格式 / 134

3.17diff：比較兩個文件的不同 / 135

3.18vimdiff：可視化比較工具 / 138

3.19rev：反向輸出文件內容 / 139

3.20tr：替換或刪除字符 / 140

3.21od：按不同進制顯示文件 / 143

3.22tee：多重定向 / 145

3.23vi/vim：純文本編輯器 / 147

3.24老男孩逆襲思想：做Linux運維的多個好處 / 152

第4章 文本處理三劍客 / 153

4.1grep：文本過濾工具 / 153

4.2sed：字符流編輯器 / 159

4.3awk基礎入門 / 165

第5章 Linux信息顯示與搜索文件命令 / 176

5.1uname：顯示系統信息 / 176

5.2hostname：顯示或設置系統的主機名 / 178

5.3dmesg：系統啟動異常診斷 / 179

5.4stat：顯示文件或文件系統狀態 / 181

5.5du：統計磁盤空間使用情況 / 183

5.6date：顯示與設置系統時間 / 186

5.7echo：顯示一行文本 / 190

5.8watch：監視命令執行情況 / 193

5.9which：顯示命令的全路徑 / 195

5.10whereis：顯示命令及其相關文件全路徑 / 196

5.11locate：快速定位文件路徑 / 197

5.12updatedb：更新mlocate數據庫 / 199

5.13老男孩逆襲思想：新手在工作中如何問問題不會被鄙視 / 200

第6章 文件備份與壓縮命令 / 201

6.1tar：打包備份 / 201

6.2gzip：壓縮或解壓文件 / 208

6.3zip：打包和壓縮文件 / 211

6.4unzip：解壓zip文件 / 212

6.5scp：遠程文件復制 / 214

6.6rsync：文件同步工具 / 216

6.7老男孩逆襲思想：新手如何高效地提問 / 220

第7章 Linux用戶管理及用戶信息查詢命令 / 222

7.1 useradd：創建用戶 / 222

7.2usermod：修改用戶信息 / 227

7.3userdel：刪除用戶 / 229

7.4groupadd：創建新的用戶組 / 230

7.5groupdel：刪除用戶組 / 231

7.6passwd：修改用戶密碼 / 232

7.7chage:修改用戶密碼有效期 / 237

7.8chpasswd：批量更新用戶密碼 / 238

7.9su：切換用戶 / 240

7.10visudo：編輯sudoers文件 / 242

7.11sudo：以另一個用戶身份執行命令 / 244

7.12id：顯示用戶與用戶組的信息 / 248

7.13w：顯示已登錄用戶信息 / 249

7.14who：顯示已登錄用戶信息 / 250

7.15users：顯示已登錄用戶 / 252

7.16whoami：顯示當前登錄的用戶名 / 253

7.17last：顯示用戶登錄列表 / 253

7.18lastb：顯示用戶登錄失敗的記錄 / 254

7.19lastlog：顯示所有用戶的最近登錄記錄 / 255

第8章 Linux磁盤與文件系統管理命令 / 257

8.1fdisk：磁盤分區工具 / 257

8.2partprobe：更新內核的硬盤分區表信息 / 265

8.3tune2fs：調整ext2/ext3/ext4文件系統參數 / 266

8.4parted：磁盤分區工具 / 268

8.5mkfs：創建Linux文件系統 / 272

8.6dumpe2fs：導出ext2/ext3/ext4文件系統信息 / 274

8.7resize2fs：調整ext2/ext3/ext4文件系統大小 / 275

8.8fsck：檢查并修復Linux文件系統 / 278

8.9dd：轉換或復制文件 / 281

8.10mount：掛載文件系統 / 284

8.11umount：卸載文件系統 / 288

8.12df：報告文件系統磁盤空間的使用情況 / 289

8.13mkswap：創建交換分區 / 293

8.14swapon：激活交換分區 / 294

8.15swapoff：關閉交換分區 / 295

8.16sync：刷新文件系統緩沖區 / 296

第9章 Linux進程管理命令 / 298

9.1ps：查看進程 / 298

9.2pstree：顯示進程狀態樹 / 305

9.3pgrep：查找匹配條件的進程 / 306

9.4kill：終止進程 / 307

9.5killall：通過進程名終止進程 / 310

9.6pkill：通過進程名終止進程 / 311

9.7top：實時顯示系統中各個進程的資源占用狀況 / 313

9.8nice：調整程序運行時的優先級 / 320

9.9renice：調整運行中的進程的優先級 / 323

9.10nohup：用戶退出系統進程繼續工作 / 324

9.11strace：跟蹤進程的系統調用 / 325

9.12ltrace：跟蹤進程調用庫函數 / 332

9.13runlevel：輸出當前運行級別 / 334

9.14init：初始化Linux進程 / 335

9.15service：管理系統服務 / 335

第10章 Linux網絡管理命令 / 338

10.1ifconfig：配置或顯示網絡接口信息 / 338

10.2ifup：激活網絡接口 / 343

ifup eth0

10.3ifdown：禁用網絡接口 / 343

ifdown eth0

service network restart（/etc/init.d/network restart） 激活整個網絡，所有網卡。

10.4route：顯示或管理路由表 / 344

10.5arp：管理系統的arp緩存 / 350

10.6ip：網絡配置工具 / 351

10.7netstat：查看網絡狀態 / 358

10.8ss：查看網絡狀態 / 362

10.9ping：測試主機之間網絡的連通性 / 363

10.10traceroute：追蹤數據傳輸路由狀況 / 366

10.11arping：發送arp請求 / 367

10.12telnet：遠程登錄主機 / 369

10.13nc：多功能網絡工具 / 370

10.14ssh：安全地遠程登錄主機 / 373

10.15wget：命令行下載工具 / 376

10.16mailq：顯示郵件傳輸隊列 / 379

10.17mail：發送和接收郵件 / 381

10.18nslookup：域名查詢工具 / 386

10.19dig：域名查詢工具 / 389

10.20host：域名查詢工具 / 393

10.21nmap：網絡探測工具和安全/端口掃描器 / 394

10.22tcpdump：監聽網絡流量 / 398

第11章 Linux系統管理命令 / 407

11.1lsof：查看進程打開的文件 / 407

11.2uptime：顯示系統的運行時間及負載 / 411

11.3free：查看系統內存信息 / 411

11.4iftop：動態顯示網絡接口流量信息 / 413

11.5vmstat：虛擬內存統計 / 415

11.6mpstat：CPU信息統計 / 419

11.7iostat：I/O信息統計 / 420

11.8iotop：動態顯示磁盤I/O統計信息 / 423

11.9sar：收集系統信息 / 425

11.10chkconfig：管理開機服務 / 430

11.11ntsysv：管理開機服務 / 433

11.12 setup：系統管理工具 / 434

11.13ethtool：查詢網卡參數 / 436

11.14mii-tool：管理網絡接口的狀態 / 437

11.19rpm：RPM包管理器 / 443

11.20yum：自動化RPM包管理工具 / 446

top命令

第12章 Linux系統常用內置命令 / 450

12.1Linux內置命令概述 / 450

12.2Linux內置命令簡介 / 450

12.3Linux常用內置命令實例 / 452

Linux常用命令

在vim或vi的編輯器中【注： 所有字符均為英文狀態下輸入】

vim跳轉到最后一行

vim跳轉至首行

vim顯示行號

vim隱藏行號

1、ngg/nG （跳轉到文件第n行，無需回車）

2、:n （跳轉到文件第n行，需要回車）

3、vim +n filename （在打開文件后，跳轉到文件的第n行）

dd：刪除游標所在的一整行(常用)

ndd：n為數字。刪除光標所在的向下n行，例如20dd則是刪除光標所在的向下20行

d1G：刪除光標所在到第一行的所有數據

dG：刪除光標所在到最后一行的所有數據

d$：刪除光標所在處，到該行的最后一個字符

d0：那個是數字0,刪除光標所在到該行的最前面的一個字符

x,X：x向后刪除一個字符(相當于[del]按鍵),X向前刪除一個字符(相當于[backspace]即退格鍵)

nx：n為數字，連續向后刪除n個字符

Linux常用基本命令（六）

1）service network status 查看指定服務的狀態

2）service network stop 停止指定服務

3）service network start 啟動指定服務

4）service network restart 重啟指定服務

5）service --status-all 查看系統中所有的后臺服務

1）chkconfig 查看所有服務器自啟配置

2）chkconfig iptables off 關掉指定服務的自動啟動

3）chkconfig iptables on 開啟指定服務的自動啟動

[root@bigdata111 ~]# service crond restart （重新啟動服務）

1）基本語法

crontab [選項]

選項：

-e： 編輯crontab定時任務

-l： 查詢crontab任務

-r： 刪除當前用戶所有的crontab任務

2）參數說明

[root@bigdata111 ~]# crontab -e

（1）進入crontab編輯界面。會打開vim編輯你的工作。

* * * * * 執行的任務

（2）特殊符號

（3）特定時間執行命令

3）案例：

*/5 * * * * /bin/echo ”11” /tmp/test

*/1 * * * * /bin/echo ”11” /opt/TZ/ITSTAR

RPM包的名稱格式

Apache-1.3.23-11.i386.rpm

- “apache” 軟件名稱

- “1.3.23-11”軟件的版本號，主版本和此版本

- “i386”是軟件所運行的硬件平臺

- “rpm”文件擴展名，代表RPM包

1）基本語法：

rpm -qa （功能描述：查詢所安裝的所有rpm軟件包）

過濾

rpm -qa | grep rpm軟件包

2）案例

[root@bigdata111 Packages]# rpm -qa |grep firefox

firefox-45.0.1-1.el6.centos.x86_64

1）基本語法：

（1）rpm -e RPM軟件包

或者（2） rpm -e --nodeps 軟件包

--nodeps 如果該RPM包的安裝依賴其它包，即使其它包沒裝，也強迫安裝。

2）案例

[root@bigdata111 Packages]# rpm -e firefox

1）基本語法：

rpm -ivh RPM包全名

-i=install，安裝

-v=verbose，顯示詳細信息

-h=hash，進度條

--nodeps，不檢測依賴進度

2）案例

[root@bigdata111 Packages]# pwd

/media/CentOS_6.8_Final/Packages

[root@bigdata111 Packages]# rpm -ivh firefox-45.0.1-1.el6.centos.x86_64.rpm

warning: firefox-45.0.1-1.el6.centos.x86_64.rpm: Header V3 RSA/SHA1 Signature, key ID c105b9de: NOKEY

Preparing... ########################################### [100%]

1:firefox ########################################### [100%]

Linux常用命令總結

ps 命令的作用是顯示進程信息的；

| 符號，是個管道符號，表示ps 和 grep 命令同時執行；

grep 命令是查找（Global Regular Expression Print），能使用正則表達式搜索文本，然后把匹配的行顯示出來；

ps命令有一些參數：

-e : 顯示所有進程

-f : 全格式

-h : 不顯示標題

-l : 長格式

-w : 寬輸出

a ：顯示終端上的所有進程，包括其他用戶的進程。

r ：只顯示正在運行的進程。

u ：以用戶為主的格式來顯示程序狀況。

x ：顯示所有程序，不以終端機來區分。

結果信息從前到后依次是：

UID PID PPID C STIME TTY TIME CMD

zzw 14124 13991 0 00:38 pts/0 00:00:00 grep –color=auto dae

Linux中的top命令顯示系統上正在運行的進程。它是系統管理員最重要的工具之一。被廣泛用于監視服務器的負載。top命令是一個交互命令。在運行top的時候還可以運行很多命令。

N – 以 PID 的大小的順序排列表示進程列表

P – 以 CPU 占用率大小的順序排列進程列表

M – 以內存占用率大小的順序排列進程列表

q – 退出 top

h – 幫助

1 系統運行時間和平均負載

這些字段顯示：當前時間、系統已運行的時間、當前登錄用戶的數量、相應最近5、10和15分鐘內的平均負載。

2 任務

第二行顯示的是任務或者進程的總結。進程可以處于不同的狀態。這里顯示了全部進程的數量。除此之外，還有正在運行、睡眠、停止、僵尸進程的數量（僵尸是一種進程的狀態）。這些進程概括信息可以用’t’切換顯示。

3 CPU 狀態

下一行顯示的是CPU狀態。 這里顯示了不同模式下的所占CPU時間的百分比。這些不同的CPU時間表示:

us, user： 運行(未調整優先級的) 用戶進程的CPU時間

sy，system: 運行內核進程的CPU時間

ni，niced：運行已調整優先級的用戶進程的CPU時間

wa，IO wait: 用于等待IO完成的CPU時間

hi：處理硬件中斷的CPU時間

si: 處理軟件中斷的CPU時間

st：這個虛擬機被hypervisor偷去的CPU時間（譯注：如果當前處于一個hypervisor下的vm，實際上hypervisor也是要消耗一部分CPU處理時間的）。

4 內存使用

接下來兩行顯示內存使用率，有點像’free’命令。第一行是物理內存使用，第二行是虛擬內存使用(交換空間)。

物理內存顯示如下:全部可用內存、已使用內存、空閑內存、緩沖內存。相似地：交換部分顯示的是：全部、已使用、空閑和緩沖交換空間。

5 各列的意思

PID 進程ID，進程的唯一標識符

USER 進程所有者的實際用戶名。

PR 進程的調度優先級。這個字段的一些值是’rt’。這意味這這些進程運行在實時態。

NI 進程的nice值（優先級）。越小的值意味著越高的優先級。

VIRT 進程使用的虛擬內存。

RES 駐留內存大小。駐留內存是任務使用的非交換物理內存大小。

SHR SHR是進程使用的共享內存。

S 這個是進程的狀態。它有以下不同的值:

D – 不可中斷的睡眠態。

R – 運行態

S – 睡眠態

T – 被跟蹤或已停止

Z – 僵尸態

%CPU 自從上一次更新時到現在任務所使用的CPU時間百分比。

%MEM 進程使用的可用物理內存百分比。

TIME+ 任務啟動后到現在所使用的全部CPU時間，精確到百分之一秒。

COMMAND 運行進程所使用的命令。

注意 ：不同發行版的top命令在各種細節有不同，如果發現不同時，請讀你的幫助手冊和命令內的幫助。）

kill、kill-15、kill-9區別:

執行kill（默認kill -15）命令，系統會發送一個SIGTERM信號給對應的程序,大部分程序接收到SIGTERM信號后，會先釋放自己的資源，然后再停止。用法kill pid。

kill -15 pid。

kill -9命令，系統給對應程序發送的信號是SIGKILL，即exit。exit信號不會被系統阻塞，所以kill -9能順利殺掉進程。用法kill -9 pid。

tail -n 1000：顯示最后1000行

tail -n +1000：從1000行開始顯示，顯示1000行以后的

head -n 1000：顯示前面1000行

cat a.txt 顯示文件

vim xx.conf 編輯文件

打開文件后，按insert鍵進入編輯模式；編輯完后，按esc建退出編輯模式；按shift+冒號后，輸入wq保存退出，wq!保存強制退出，q不保存退出

在根目錄模糊查找名字含java的文件

服務器端常有很多壓縮過的日志文件，當需要查找日志中某些特定信息的時候，為了避免解壓文件，可以使用zgrep，zcat等命令查找、查看壓縮文件中的信息

zgrep ' 輸入你要查找的東東' /目錄 /文件 .gz 或者.log （當日）

grep ' 輸入你要查找的東東' /目錄 /文件 .gz 或者.log （非當日的壓縮文件）

例如： zgrep 'callMktCamLoad' app.log.2019-12-03-*.gz

rpm包安裝的，可以用 rpm -qa 看到，如果要查找某軟件包是否安裝，用 rpm -qa | grep "軟件或者包的名字"

以deb包安裝的，可以用 dpkg -l 看到。如果是查找指定軟件包，用 dpkg -l | grep "軟件或者包的名字"

yum方法安裝的，可以用 yum list installed 查找，如果是查找指定包，用 yum list installed | grep "軟件名或者包名"

linux常用命令

linux常用命令如下：

1、查看內核版本：uname -a。

2、控制臺-圖形界面：init 5或者startx。

3、圖形界面-控制臺: init3或者直接注銷。

4、如何查看ip地址：ifconfig。

5、配置ip:ifconfig eth0 ip地址。

6、重啟：reboot 或者 shutdown -r now。

操作命令

首先介紹一個名詞“控制臺”，它就是我們通常見到的使用字符操作界面的人機接口，例如dos。我們說控制臺命令，就是指通過字符界面輸入的可以操作系統的命令，例如dos命令就是控制臺命令。我們要了解的是基于Linux操作系統的基本控制臺命令和dos命令不同的是，Linux的命令（也包括文件名等等）對大小寫是敏感的。

當前名稱：linux常用命令符號 linux中各種命令
文章源于：http://vcdvsql.cn/article22/doscdcc.html

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