這篇文章主要為大家展示了“circ2Traits數據庫有什么用”，內容簡而易懂，條理清晰，希望能夠幫助大家解決疑惑，下面讓小編帶領大家一起研究并學習一下“circ2Traits數據庫有什么用”這篇文章吧。

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miRNA的研究起步很早，miRNA與疾病相關的文獻和數據庫也相對成熟，而circRNA作為最近興起的一種RNA, 可以作為miRNA  sponger與miRNA結合， 發揮轉錄后調控功能。

circ2Traits是一個環狀RNA相關的疾病或者特殊性狀的數據庫，通過分析環狀RNA與那些疾病相關的miRNA的相互作用，從而在環狀RNA和疾病之間建立起關聯。同時為了進一步分析環狀RNA在疾病中的調控路徑，還構建了circRNA的ceRNA調控網絡。該數據庫的網址如下

http://gyanxet-beta.com/circdb/

數據庫的構建需要依賴以下4種信息，對應的來源描述如下

1. 從miR2disease數據庫得到疾病相關的miRNA信息

2. 從Memzcak等人的研究中得到環狀RNA與miRNA的相互作用關系

3. 從starBase數據庫得到miRNA-mRNA的相互作用信息

4. 從miRCode數據庫得到miRNA和lncRNA的相互作用信息

目前官網只提供了數據下載的功能，示意如下

第一個文件是ceRNA調控網絡信息，內容示意如下，第一類為miRNA,第二列為protein coding或者lncRNA轉錄本，第三列為環狀RNA,第四列為疾病的名稱

第二個文件是環狀RNA的所有信息，包含了circRNA-miRNA和circRNA和miRNA結合區域的SNP信息，內容列數很多，截取如下

通過該數據庫，可以得到疾病相關的環狀RNA信息，同時其分析疾病相關的環狀RNA的思路和將circRNA,ceRNA，SNP信息整合的策略都值得借鑒。

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文章標題：circ2Traits數據庫有什么用
地址分享：http://vcdvsql.cn/article26/pcogcg.html

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