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如何在python中利用lmdb對數(shù)據(jù)進行讀取-創(chuàng)新互聯(lián)

如何在python中利用lmdb對數(shù)據(jù)進行讀取?針對這個問題,這篇文章詳細介紹了相對應(yīng)的分析和解答,希望可以幫助更多想解決這個問題的小伙伴找到更簡單易行的方法。

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由于c++速度快,所以一般寫入數(shù)據(jù)我調(diào)用c++借口,而讀取數(shù)據(jù)使用c++也行,但有時候Python在某方面方便,所以通過使用python借口僅僅對lmdb文件讀取,處理數(shù)據(jù)是圖片

import lmdb
import numpy as np
import cv2
lmdb_file = "/home/rui/demo"
lmdb_env = lmdb.open(lmdb_file)
lmdb_txn = lmdb_env.begin()
lmdb_cursor = lmdb_txn.cursor()
for key, value in lmdb_cursor:
  img = cv2.imdecode(np.fromstring(value, np.uint8), 3);
  cv2.imshow("demo", img)
  cv2.waitKey(0)

補充知識:Python解析lmdb格式mnist數(shù)據(jù)集

背景

HDF5和LMDB都是Cafffe中常用的數(shù)據(jù)庫。相對來說,HDF5的讀寫格式簡單;LMDB采用內(nèi)存-映射文件(memory-mapped files),所以擁有非常好的I/O性能,而且對于大型數(shù)據(jù)庫來說,HDF5的文件常常整個寫入內(nèi)存。

所以HDF5的文件大小就受限于內(nèi)存大小,當(dāng)然也可以通過文件分割來解決問題,但其I/O性能就不如LMDB的頁緩存(page cachiing)策略了。

MNIST手寫數(shù)字字符識別實驗在deep learning 中經(jīng)常用到,這里使用Python來獲取lmdb格式MNIST數(shù)據(jù)集中的圖片并顯示出來

Python讀取LMDB

首先確認你安裝了lmdb和Caffe的python包(Caffe中的pycaffe)。

pip install lmdb

LMDB采用鍵值對的存儲格式,key就是字符形式的ID,value是Caffe中Datum類的序列化形式。

# -*- coding:utf-8 -*-
import caffe
from caffe.proto import caffe_pb2
import lmdb
import cv2 as cv
env = lmdb.open("mnist_train_lmdb", readonly=True) # 打開數(shù)據(jù)文件
txn = env.begin() # 生成處理句柄
cur = txn.cursor() # 生成迭代器指針
datum = caffe_pb2.Datum() # caffe 定義的數(shù)據(jù)類型
for key, value in cur:
  print(type(key), key)
  datum.ParseFromString(value) # 反序列化成datum對象
  label = datum.label
  data = caffe.io.datum_to_array(datum)
  print data.shape
  print datum.channels
  image = data[0]
  # image = data.transpose(1, 2, 0)
  print(type(label))
  cv.imshow(str(label), image)
  cv.waitKey(0)
cv.destroyAllWindows()
env.close()

運行結(jié)果:

如何在python中利用lmdb對數(shù)據(jù)進行讀取

如何在python中利用lmdb對數(shù)據(jù)進行讀取

讀取LMDB數(shù)據(jù)庫中的Datum數(shù)據(jù),這里再稍微介紹一下Datum的格式:channels:圖片的通道,彩色圖有3個通道,灰度圖只有1通道,當(dāng)然也可以用通道數(shù)來表示其他意思,比如表示兩張圖片,每個通道一個單張的圖;height:圖片(即data)的高;width:圖片(即data)的寬;data:圖片的數(shù)據(jù)(像素值);label:圖片的label。(datum.channels, datum.height, datum.width)

關(guān)于如何在python中利用lmdb對數(shù)據(jù)進行讀取問題的解答就分享到這里了,希望以上內(nèi)容可以對大家有一定的幫助,如果你還有很多疑惑沒有解開,可以關(guān)注創(chuàng)新互聯(lián)行業(yè)資訊頻道了解更多相關(guān)知識。

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