2024-01-22 分類: 網(wǎng)站建設
深圳2021年12月3日 /美通社/ -- 近日,國際人類蛋白質(zhì)組計劃確定,由承啟生物承接國際人類蛋白質(zhì)組計劃的官方數(shù)據(jù)庫neXtProt(亞洲分站)的建設。這是國際人類蛋白質(zhì)組計劃第一次將官方數(shù)據(jù)庫交由亞洲公司進行建設,標志著中國在人類蛋白質(zhì)組計劃中的核心地位提升,也顯示出承啟生物不僅僅在測序領域取得國際聲譽,同時在蛋白質(zhì)組學領域也受到國際學術界的權威認可。11月底,承啟與neXtProt數(shù)據(jù)庫工作人員進行視頻連線會議,neXtProt亞洲分站的建設正式開始。
承啟團隊與neXtProt工作人員視頻連線會議
國際人類蛋白質(zhì)組計劃(Human Proteome Project, HPP)是國際人類基因組計劃(Human Genome Project, HGP)的后續(xù)國際合作項目,最早可追溯至2000年彼時,人類基因組計劃尚未完成,科學家們就已經(jīng)意識到搞清楚人類基因組并不能完全理解人的生理病理過程,因為一個基因可以變化出幾種至數(shù)千種不同的蛋白質(zhì)形體(proteoform),而蛋白質(zhì)才是各種生理和病理功能的實際執(zhí)行者因此,各國科學家又策劃了人類蛋白質(zhì)組計劃,力圖研究所有的人類蛋白質(zhì),這樣才能解開生命的奧秘經(jīng)過12年的前期準備,2012年人類蛋白質(zhì)組計劃正式啟動。
人類蛋白質(zhì)組計劃的官方數(shù)據(jù)庫是neXtProt ,目的是建立一個人類蛋白質(zhì)的百科全書這個龐大的數(shù)據(jù)庫最初由瑞典的瑞士生物信息學研究所(Swiss Institute of Bioinformatics) 和GeneBio SA 共同開發(fā),不但存儲了大量的人類蛋白質(zhì)知識庫,也有大量蛋白質(zhì)組、微陣列、RNA、蛋白質(zhì)相互作用、蛋白質(zhì)-小分子相互作用等高質(zhì)量數(shù)據(jù)集,其上的數(shù)據(jù)頻繁地更新,是人類蛋白質(zhì)研究的集大成者,相當于研究人類蛋白質(zhì)的基礎設施。
neXtProt數(shù)據(jù)庫網(wǎng)站界面
隨著人類蛋白質(zhì)研究的不斷深入,neXtProt數(shù)據(jù)庫的容量越來越大,服務器負荷日漸沉重中國日益增長的科研實力使得中國學者訪問該數(shù)據(jù)庫的需求與日俱增,但現(xiàn)有數(shù)據(jù)庫的資源卻遠遠不能滿足要求雪上加霜的是,因為疫情和經(jīng)濟原因,瑞士政府削減了對這一生物信息基礎設施的投資,使neXtProt數(shù)據(jù)庫無力進行擴容為了推動人類科學界對人類蛋白質(zhì)組的研究,尋找有實力、有口碑的單位進行合作就成為其最佳選擇最終,承啟被選定為neXtProt亞洲分站的承建單位。
雖然承啟的主營業(yè)務主要是與大規(guī)模測序相關,由于其自研的FANSe系列高精度測序比對算法而被業(yè)界熟知,但承啟在蛋白質(zhì)組上的積累很早就開始了早在2014年,承啟首席科學家張弓教授所建立的翻譯組測序技術就被作為人類蛋白質(zhì)組計劃的核心支柱之一,并連續(xù)被HUPO(人類蛋白質(zhì)組組織)邀請在HUPO大會上做演講2017年,承啟在HUPO大會上宣布免費為人類蛋白質(zhì)組計劃提供翻譯組測序服務2018年,承啟發(fā)布了當時世界上最強的翻 譯組學數(shù)據(jù)庫,為蛋白質(zhì)組研究提供了重要的參考,該數(shù)據(jù)庫被發(fā)表在國際權威期刊Nucleic Acids Research上2019年,張弓教授發(fā)表重大成果,通過翻譯組測序技術發(fā)現(xiàn)了數(shù)千個原本認為不可能編碼蛋白質(zhì)的非編碼基因?qū)嶋H上能翻譯出50個氨基酸以上的蛋白質(zhì),并且這些蛋白質(zhì)穩(wěn)定存在,在癌癥中發(fā)揮著重要作用,人類基因組需要被系統(tǒng)性地重新注釋承啟在這一研究中提供了核心的生物信息學分析服務因此承啟被委以此重任,絕非偶然。
對承啟而言,常年具備處理海量組學數(shù)據(jù)的能力,可以完全承擔建立neXtProt所需的服務器資源和技術資源,因此neXtProt亞洲分站的建設和運維都將由承啟負責。
承啟承建人類蛋白質(zhì)組計劃官方數(shù)據(jù)庫neXtProt的亞洲分站,標志著中國在人類蛋白質(zhì)組計劃中的核心地位提升,這是承啟為推動人類蛋白質(zhì)組計劃進展、為中國和亞洲的蛋白質(zhì)科學發(fā)展的又一貢獻。
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